Desde su creación en 1929 la investigación biomédica y la formación científica han sido objetivos básicos del Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, entendiendo que es imposible separar una asistencia clínica de calidad de una investigación biomédica y una formación de alto nivel.

Por ello el objetivo fundamental del IFIMAV es potenciar y facilitar estas áreas y hacerlas extensibles a todos los hospitales y niveles asistenciales del Servicio Cántabro de Salud y de la Universidad. En este momento contamos con 25 grupos de investigación (21 consolidados y 4 emergentes) y alrededor de 230 profesionales, de los que 80 son investigadores principales. Sus líneas de investigación se integran en las seis áreas siguientes: cáncer, neurociencias, enfermedades infecciosas y sistema inmune, trasplantes de órganos y tejidos y nuevas terapias, metabolismo, envejecimiento y hábitos de vida, y epidemiología y salud pública.

En los últimos cinco años han publicado mas de 1.000 trabajos. El número de trabajos anuales oscila alrededor de 200 con un factor de impacto medio de 520. El 70% de los trabajos originales se publican en revistas del primer o segundo quartil. Los investigadores del IFIMAV están integrados en el Consolider (Centrosoma), en los CIBER de Enfermedades neurodegenerativas (CIBERNed) y de Epidemiología y Salud Pública, y en las RETICs de Patología Infecciosa (REIPI), Cáncer (RTICC), Enfermedades renales (REDINREN) y Envejecimiento y fragilidad (RETICEF), En los últimos cinco años la financiación que ha recibido el IFIMAV ha sido cercana a los 16 millones de euros. En este momento la financiación externa obtenida anualmente se acerca a los tres millones de euros.