1. Proteómica de listeriosis y sistema inmune en comparación con otras infecciones bacterianas.
2. Genómica y proteómica de la interacción Listeria-fagosoma.
3. Estudios espacio-temporales de infecciones bacterianas en cultivos organotípicos de SNC.
4. Proteínas lisosomales y respuesta inmune frente a infecciones.
5. Inmunogenética de la infección por parásitos intracelulares (Mycobacterium tuberculosis) en diferentes poblaciones humanas (argelina, española y peruana).

6. Epítopos inmunodominantes multiméricos en infecciones bacterianas. Inmunidad de procesos pro-inflamatorios.
7. Aspectos inmunogenéticos e inmunobiológicos de la infección durante el transplante alogénico.
8. Genómica poblacional de la cornisa cantábrica en relación con otras poblaciones mundiales y su relevancia en aloinmunidad y autoinmunidad.
